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经调查东沙海域至2013年止，已累积记录的鱼类计有73科690种，其中以隆头鱼科（13%）、鰕鯱科（12%）、雀鲷科（9%），以及天竺鲷科（6%）为最多。这些鱼类当中包含1种南海特有种、12种台湾没有纪录的鱼种、8种东沙很普遍而台湾外围海域稀有的鱼种。
环礁典型-东沙代表性鱼种
在东沙环礁海域调查中以隆头鱼科、虎科，以及雀鲷科为最多。这些鱼类当中包含了南海特有种、台湾没有纪录的鱼种、东沙很普遍而台湾外围海域稀有的鱼种。台湾无纪录或是稀有的鱼种，大都出现在环礁内，牠们属于「典型潟湖鱼种」，喜欢平静无波的浅水域、偏好以死珊瑚碎屑为底质的环境；至于环礁外围，则属于标准的珊瑚礁鱼类，这裡的环境与台湾南部海域类似，因此，几乎所有的鱼种也都能在垦丁、澎湖、兰屿、绿岛等海域见到。
南海特有种：黄头刻齿雀鲷是东沙发现鱼种中唯一分布范围只在南中国海的鱼种。
台湾外围海域无纪录的鱼种：小天竺鲷、梵虎鱼之未命名种、丝棘栉虎、线斑衔虎、黑腹矶塘鳢、繸凤、黑背盘雀鲷、密鳃雀鲷、蓝点雀鲷、隐雀鲷。
广布于潟湖内而台湾外围海域罕见的鱼种：六带盖刺鱼、犬牙锥齿鲷、长吻鹦哥鱼、短唇钝鲨、丝背磨塘鳢、胸斑矶塘鳢、楔斑猪齿鱼、横带唇鱼。
另外，暗褐高鳍与伸口鱼，虽然不特别偏好潟湖环境，但在东沙亦很普遍，而台湾其他海域少见；丝鳍圆天竺鲷则是因人们过度捕捞而在台湾睽违已久的鱼种。
珊城之内-潟湖区鱼种
环礁潟湖内，活珊瑚的消失对环礁内的鱼类相组成造成相当程度的影响。白化死亡后的珊瑚礁块上，长出了许多藻类等附著生物，让草食性的鱼类可以安栖。远远地观察就可以看见许多刺尾鲷、隆头鱼及舵鱼等鱼类穿梭在礁块之间，若再更靠近仔细寻找，在礁洞缝隙中还栖息著大量天竺鲷、石鲈以及金鳞鱼；礁体缝隙栖息著裸胸鯙；虎、虎、秋姑鱼则在沙上觅食栖息，当秋姑鱼用嘴巴搅动沙地搜寻好料时，后面还会跟著以隆头鱼为主要阵容的捡便宜的傢伙；而分枝形轴孔珊瑚丛则是草食性雀鲷的「农田」，牠们和人类一样会「种菜」，也会顾菜园，只要有不速之客趋近，都会被牠们驱逐出境。
潟湖中的定栖性鱼包括几种雀鲷——活动于软珊瑚上的三带圆雀鲷、在礁体上活动的摩鹿加雀鲷、五线巨齿天竺鲷，以及会养海藻的钝头高身雀鲷；定栖于沙地，与枪虾共生的丝鳍栉虎、红纹钝鲨；日间回到礁区休息，晚上到沙地觅食的黑鳍金鳞鱼、莎姆金鳞鱼；完全在枝状珊瑚间活动的黄体短虎；与海葵共生的白条海葵鱼，以及栖息于枝状珊瑚及棘冠海星的棕线管天竺鲷等等，都是属于定栖性鱼种。
前面介绍过的横带唇鱼、伸口鱼则是属于典型的半定栖性鱼种，活动于礁区附近；鬚海绯鲤、黑带赤尾冬与三带赤尾冬在礁体下方沙地，要觅食才会上到中层水域。介于半定栖与巡游鱼之间的则是鹦哥鱼，以及褐拟鳞魨、丝背磨塘鳢等；巡游性鱼种有蓝鳍、天竺舵鱼。
礁区典型-外环礁北、南、东面鱼种
外环礁北面活珊瑚覆盖率相当高，以软珊瑚为主。在这裡偶尔可以看到老熟的大型盖刺鱼，机警怕人。软珊瑚亦是玳瑁的主要食物之一，以往在环礁中有非常多的玳瑁，会爬上东沙岛产卵的也是本种海龟，然而因为人类的大肆捕捉，现在已几乎没有再出现过。
外环礁南面与东面亦有相当良好的活珊瑚覆盖率，以石珊瑚居多，配合多变的底质地貌，让礁区鱼类能有更多地方栖息。珊瑚间隙能提供良好的保护，是小型鱼类如圆雀鲷、科鱼类最喜欢的区域，而珊瑚礁座底部的洞穴，通常是夜行性的金鳞鱼等白天休息的地方。珊瑚礁的顶端经常趴著一隻科的鱼类，在那裡东张西望。外环礁由于与大洋接触，偶尔会有洄游性的科鱼类经过觅食，有时一群出现达数十隻，相当壮观。
此区的定栖性鱼种以礁体间觅食、栖息为多数，包括几种鳞魨、，以及双棘、海氏、福氏等三种盖刺鱼；两色光鳃雀鲷、凡氏光鳃雀鲷、斑卡雀鲷、霓虹雀鲷，以及尾纹九刺鮨、库伯氏拟花鲈等两种鮨科鱼类。花斑拟鳞魨、副革单棘魨、瓦氏尖鼻魨等鳞魨科鱼类以及双斑海猪鱼、多纹褶唇鱼、钝头锦鱼等则在礁体附近趴趴走；几种蝴蝶鱼包括「克氏」、「黑背」、「点斑横带」、「一点」、「红尾」等等则在更大的礁区范围内游走。
定栖于珊瑚枝丛的则有拟刺尾鲷、、短多鬚；俗称「狮子鱼」的斑马纹多臂簑鮋以及两种金鳞鱼「尾斑棘鳞鱼」、「黑点棘鳞鱼」选择礁洞。
在沙地活动的，除了短吻软棘鱼与丝鳍线塘鳢定栖于沙地之外，多属于半定栖鱼种，盖马氏盔鱼、背斑盔鱼、圆口海绯鲤等活动于沙地附近；双带狐鲷、双斑狐鲷在沙地与礁石之间；选择碎珊瑚与沙地混合的则是史氏鹦哥鱼。鰺科的星点若则巡游于中低水层。
礁沙混栖－外环礁西面鱼种
环形的东沙环礁礁台只有在西侧出现两个较大的缺口，分别位于东沙岛的南北面，又称为南、北水道。水道水深约十多公尺，大部份是礁沙底质，偶尔有几座珊瑚礁座，大多也呈现白化死亡后的复健阶段，也因此喜欢吃活珊瑚的鹦哥鱼在此处较少出现。多沙的底质吸引大量秋姑鱼在此地觅食，白天成群在礁区休息的笛鲷，晚上也会化整为零地回到沙地觅食、补充能量；在礁座底部则有石鲈、金鳞鱼、刺尾鲷等聚集，石鲈为夜行性鱼，每天循固定路线出去，游上一、两公里的路程沿路觅食，白天才回到礁区休息，这时正是刺尾鲷活动的时候。除了珊瑚礁座之外，南北水道口在近代曾经发生过数次船难，铁壳船身散落在海底，于是形成了鱼类的新宿舍。
外环礁西侧为礁沙交错的地形，有许多大礁洞，鱼类群聚与外环礁其他三区明显不同，大部分栖息于礁洞，也有许多栖沙的鱼种，栖沙的鱼种基本上与潟湖内的鱼种有不少雷同，因此此区呈现的鱼种，以礁洞栖息为多数，栖沙居次。
栖息于礁洞中的鱼种包括属于金鳞鱼科的焦松毬、紫松毬、凸颌松毬、尖吻棘鳞鱼等；而在礁区附近活动的半定栖性鱼种数最多，包括两种刺尾鲷、黄镊口鱼、「扬旛」、「胡麻斑」、「鞍斑」、「雷氏」等几种蝴蝶鱼；石鲈定栖于沙地，管唇鱼、金带拟鬚鲷、短鬚海绯鲤、双带海绯鲤等则于附近的沙地活动。马氏乌尾、横带若与低鳍舵鱼跑得最远，在外环礁西侧四处巡游。
资料来源：東沙環礁國家公園網站（台）。 |
